กล้องจุลทรรศน์ใช้แสงแบบสเตอริโอ (Stereoscopic Microscope)
รูปที่ปรากฏจะเป็นภาพสามมิติ คือ นอกจากจะมีความกว้าง ความยาว แล้วยังมีความหนา แสงที่ส่องวัตถุมาจากทุกทิศทาง แล้วสะท้อนกลับเข้าไปในตัวกล้อง หรือมาจากด้านใต้วัตถุที่ส่องแสงสว่างสามารถส่องผ่านได้ การเลือกใช้แสงขึ้นอยู่กับลักษณะของวัตถุที่นำมาตรวจ ว่ามีลักษณะทึบหรือใส กล้องชนิดนี้สามารถเลือกปรับความชัดของภาพ ในความสูงของตัวอย่างระดับต่างๆกัน